R 与数学建模

植体周炎预测模型:Logistic 回归分析及列线图模型

数据准备:使用 sample 函数对原始数据进行随机抽样,抽取 70% 的数据作为训练集(n=329),其余的作为测试集(n=141),抽样结果(训练集)保存在 sample.txt 文件中。
建立模型:使用 stats 程序包中的 glm 函数对训练集数据使用单因素和多因素 Logistic 回归分析,确定发生植体周炎的危险因素(P < 0.05)。用多因素 Logistic 回归分析的结果计算 OR 值,并借助 boot 程序包,使用 Bootstrap 法计算 OR 的 95% 置信区间。使用 rms 程序包建立列线图预测模型。
验证模型:分别借助 rms 程序包中的 calibrate 函数和 pROC 程序包中的 plot.roc 函数,使用 C-index 和校准曲线来检验模型的区分度和校准度。Logistic 回归的 C-index 即为 ROC 曲线下面积(AUC)。内部验证和外部验证分别使用训练集和测试集数据进行。

R 语言

R 语言基础,主要参考:

数据科学相关见 R 数据科学

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